Наиболее значимой причиной развития хронического энтерита является перенесенная в прошлом желудочно-кишечная инфекция, т.е. острый энтерит. Инфекция является причиной почти 50% всех случаев хронического энтерита. Чаще всего заболевание развивается после сальмонеллеза, стафилококковой инфекции, иерсиниоза. Немалую роль в развитие болезни играют гельминты (глисты).
Предрасполагающим фактором к развитию хронического энтерита также является погрешность в питании: еда всухомятку, пища бедная витаминами и богатая углеводами, злоупотребление алкоголем.
Также одним из немаловажных факторов развития болезни является пищевая аллергия, ведь проявления аллергии в виде сыпи на коже — только внешние проявления аллергизации, то же самое происходит и во внутренних органах, в том числе и кишечнике.
Многие химические вещества, такие как мышьяк, свинец, ртуть, цинк, а также лекарственные вещества: антибиотики, нестероидные противовоспалительные средства, обладают способностью повреждать слизистую кишечника и приводить к хронизации процесса.
Существует еще десяток более редких причин развития заболевания, начиная от аномалий развития кишечника и заканчивая послеоперационными осложнениями, но все же самые основные причины развития хронического энтерита уже перечислены. Независимо от причин возникновения энтерита в кишечнике при заболевании происходят одинаковые изменения.